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Xevinapant (AT406) IAP antagonist

Cat. No.: S2754

Xevinapant (AT406, ARRY-334543, Debio1143, SM-406) is a potent Smac mimetic and an antagonist of IAP (inhibitor of apoptosis protein via E3 ubiquitin ligase), binding to XIAP-BIR3, cIAP1-BIR3 and cIAP2-BIR3 with Ki of 66.4 nM, 1.9 nM, and 5.1 nM, 50- to 100-fold higher affinities than the Smac AVPI peptide. Phase 1.
Xevinapant (AT406) IAP antagonist Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 561.71

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Control de calidad (Quality Control)

Lote: Pureza: 99.96%
99.96

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
EVSA-T Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human sensitive EVSA-T cells assessed as inhibition of cell growth after 72 hrs by Alamar Blue assay, EC50 = 0.0021 μM. 26218264
MDA-MB-231 Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human sensitive MDA-MB-231 cells assessed as inhibition of cell growth after 72 hrs by Alamar Blue assay, EC50 = 0.019 μM. 26218264
HEK293 Function assay 2 hrs Antagonist activity at full-length FLAG-tagged XIAP (unknown origin) transfected in HEK293 cells assessed as inhibition of interaction with caspase 9 after 2 hrs by immunoprecipitation assay, EC50 = 0.034 μM. 26218264
SKOV3 Growth inhibition assay 4 days Growth inhibition of human SKOV3 cells after 4 days by WST8 assay, IC50 = 0.142 μM. 21443232
MDA-MB-231 Growth inhibition assay 4 days Growth inhibition of human MDA-MB-231 cells after 4 days by WST8 assay, IC50 = 0.144 μM. 21443232
MDA-MB-231 Function assay 10 nM Induction of degradation of cIAP1 in human MDA-MB-231 cells at 10 nM by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Function assay 100 nM 15 mins Induction of degradation of cIAP1 in human MDA-MB-231 cells at 100 nM after 15 mins by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Apoptosis assay 1.5 uM 12 hrs Induction of apoptosis in human MDA-MB-231 cells assessed as activation of caspase-3 activity at 1.5 uM after 12 hrs by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Apoptosis assay 1.5 uM 12 hrs Induction of apoptosis in human MDA-MB-231 cells assessed as activation of PARP cleavage at 1.5 uM after 12 hrs by Western blot analysis 21443232
MDA-MB-231 Antitumor assay 30 mg/kg 2 weeks Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in SCID mouse assessed inhibition of tumor growth at 30 mg/kg, po administered daily for 5 days/week for 2 weeks 21443232
MDA-MB-231 Antitumor assay 100 mg/kg 2 weeks Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in SCID mouse assessed inhibition of tumor growth at 100 mg/kg, po administered daily for 5 days/week for 2 weeks 21443232
MDA-MB-231 Antitumor assay 100 mg/kg every 3 days Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in Balb/c SCID mouse assessed as tumor growth inhibition at 100 mg/kg, po qd measured every 3 days 26218264
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Saos-2 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-MC cells 29435139
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for TC32 cells 29435139
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Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecular 561.71 Fórmula

C32H43N5O4

 Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 1071992-99-8 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos ARRY-334543, Debio1143, SM-406 Smiles CC(C)CC(=O)N1CCC2CCC(N2C(=O)C(C1)NC(=O)C(C)NC)C(=O)NC(C3=CC=CC=C3)C4=CC=CC=C4

Solubilidad (Solubility)

In vitro
Lote:

DMSO : 112 mg/mL (199.39 mM)
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Ethanol : 112 mg/mL

Water : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
cIAP1-BIR3
(cell-free assay)
1.9 nM(Ki)
cIAP2-BIR3
(cell-free assay)
5.1 nM(Ki)
XIAP-BIR3
(cell-free assay)
66.4 nM(Ki)
In vitro
AT-406 is a Smac mimetic and appears to mimic closely the AVPI peptide in both hydrogen bonding and hydrophobic interactions with XIAP, with additional hydrophobic contacts with W323 of XIAP. AT-406 is more sensitive to these IAPs than Smac AVPI peptide with 50-100 fold binding affinities. AT-406 (at 1 μM) completely restores the activity of caspase-9, which is suppressed by 500 nM XIAP BIR3 in a cell-free system. In MDA-MB-231 cell, AT-406 induces rapid cellular cIAP1 degradation and also pulls down the cellular XIAP protein. AT-406 effectively inhibits lots of human cancer cell lines and shows IC50 of 144 and 142 nM in MDA-MB-231 cell and SK-OV-3 ovarian cell, with low toxicity against normal-like human breast epithelial MCF-12F cells and primary human normal prostate epithelial cells. AT-406 induces apoptosis in MDA-MB-231 cell by inducing activation of caspase-3 and cleavage of PARP.
Ensayo de quinasa
Ensayos basados en polarización de fluorescencia para proteínas XIAP, cIAP1 y cIAP2 BIR3
FL-AT-406 (el AT-406 marcado fluorescentemente) se emplea para desarrollar un conjunto de nuevos ensayos de FP para la determinación de las afinidades de unión de los miméticos de Smac a las proteínas XIAP, cIAP-1 y cIAP-2 BIR3. El valor de Kd de FL-AT-406 a cada proteína IAP se determina mediante experimentos de titulación utilizando una concentración fija de FL-AT-406 y diferentes concentraciones de la proteína hasta la saturación completa. Los valores de polarización de fluorescencia se miden utilizando un lector de placas Infinite M-1000 en placas Microfluor 2 de 96 pocillos, negras, de fondo redondo. A cada pocillo, se añade FL-AT-406 (2, 1 y 1 nM para experimentos con XIAP BIR3, cIAP-1 BIR3 y cIAP-2 BIR3, respectivamente) y diferentes concentraciones de la proteína a un volumen final de 125 μL en el tampón de ensayo (100 mM fosfato de potasio, pH 7,5, 100 μg/mL γ-globulina bovina, 0,02% azida sódica, con 4% DMSO). Las placas se mezclan y se incuban a temperatura ambiente durante 2-3 horas con agitación suave. Los valores de polarización en unidades de milipolarización (mP) se miden a una longitud de onda de excitación de 485 nm y una longitud de onda de emisión de 530 nm. Las constantes de disociación en equilibrio (Kd) se calculan ajustando los aumentos sigmoides de FP dependientes de la dosis en función de las concentraciones de proteína utilizando el software Graphpad Prism 5.0. En experimentos de unión competitiva para XIAP3 BIR3, AT-406 se incuba con 20 nM de proteína XIAP BIR3 y 2 nM de FL-AT-406 en el tampón de ensayo (100 mM fosfato de potasio, pH 7,5; 100 μg/mL γ-globulina bovina; 0,02% azida sódica). En experimentos de unión competitiva para la proteína cIAP1 BIR3, se utilizan 3 nM de proteína y 1 nM de FL-AT-406. En experimentos de unión competitiva para cIAP2 BIR3, se utilizan 5 nM de proteína y 1 nM de FL-AT-406. Para cada experimento de unión competitiva, los valores de polarización se miden después de 2-3 horas de incubación utilizando un lector de placas Infinite M-1000. El valor IC50, la concentración del inhibidor a la que el 50% del trazador unido es desplazado, se determina a partir de la gráfica utilizando un análisis de mínimos cuadrados no lineales. El ajuste de la curva se realiza utilizando el software PRISM. Se calcula un valor Ki para AT-406.
In vivo
AT-406 has good pharmacokinetic (PK) properties and oral bioavailability in mice, rats, non-human primates, and dogs. In the MDA-MB-231 xenograft, AT-406 effectively induces cIAP1 degradation and processing of procaspase-8, cleavage of PARP in tumor tissues at 100 mg/kg with well toleration even at 200 mg/kg. AT-406 induces significant tumor growth inhibition with p of 0.0012 at 100 mg/kg.
Referencias

Aplicaciones (Applications)

Métodos Biomarcadores Imágenes PMID
Western blot cIAP-1 / XIAP / Mcl-1 / pS6K1 / Cleaved PARP
S2754-WB1
28036295
Growth inhibition assay Cell viability
S2754-viability1
28036295

Información del ensayo clínico (Clinical Trial Information)

(datos de https://clinicaltrials.gov, actualizado el 2024-05-22)

Número NCT Reclutamiento Condiciones Patrocinador/Colaboradores Fecha de inicio Fases
NCT01265199 Terminated
Acute Myelogenous Leukemia (AML)
Ascenta Therapeutics|The Leukemia and Lymphoma Society
 February 2011 Phase 1
NCT01078649 Completed
Cancer|Solid Tumors|Lymphoma|Malignancy
Debiopharm International SA
 March 29 2010 Phase 1