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RG108 DNA Methyltransferase inhibidor

Cat. No.S2821

RG108 (N-Ftalil-L-triptófano) es un inhibidor de la DNA methyltransferase con una IC50 de 115 nM en un ensayo sin células, y este compuesto no causa el atrapamiento de enzimas covalentes.
RG108 DNA Methyltransferase inhibidor Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 334.33

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Control de calidad

Lote: Pureza: 99.82%
99.82

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
human THP1 cells Function assay Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM 18620381
human HepG2 cells Function assay Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM 19167888
rat macrophages Function assay 24 h Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM 19464189
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Function assay 100 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE 25801160
MCF7 Function assay 50 to 500 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER 25801160
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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Información química, almacenamiento y estabilidad

Peso molecular 334.33 Fórmula

C19H14N2O4

Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 48208-26-0 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos N-Phthalyl-L-tryptophan Smiles C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O

Solubilidad

In vitro
Lote:

DMSO : 66 mg/mL (197.4 mM)
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Ethanol : 66 mg/mL

Water : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción

Targets/IC50/Ki
DNA methyltransferase
(Cell-free assay)
115 nM
In vitro
RG108 bloquea eficazmente las DNA methyltransferases in vitro y no causa el atrapamiento covalente de enzimas en líneas celulares humanas. La incubación de células con bajas concentraciones micromolares de este compuesto da como resultado una desmetilación significativa del ADN genómico sin toxicidad detectable. Curiosamente, causa la desmetilación y reactivación de genes supresores de tumores, pero no afecta la metilación de las secuencias satélite centroméricas. En otro estudio, se investiga la síntesis y el análisis in vitro de un conjugado biotinilado de esta sustancia química para evaluar las interacciones con las enzimas DNA methyltransferase. En un estudio reciente, se demuestra que este compuesto puede reducir significativamente la actividad de las DNA methyltransferases en células iPS derivadas de SM en comparación con las SM nativas.
Ensayo de quinasa
Ensayo de metilación in vitro
El ADN sustrato para el ensayo de metilación in vitro es un fragmento de 798 pb (–423/+375 con respecto al codón de iniciación) de la región promotora del gen humano p16Ink4a. La reacción de metilación contiene de 350 a 400 ng de ADN sustrato y 4 unidades de metilasa M.SssI (0,5 μM) en un volumen final de 50 μL. Este compuesto se añade a concentraciones finales de 10, 100, 200 y 500 μM, respectivamente. Las reacciones se realizan a 37 °C durante 2 horas. Una vez finalizada, la reacción se inactiva a 65 °C durante 15 minutos y el ADN se purifica utilizando un kit de purificación de PCR. Trescientos nanogramos de ADN purificado se digieren durante 3 horas a 60 °C con 30 unidades de BstUI y se analizan en geles de agarosa de Tris-borato EDTA al 2 %.
Referencias

Soporte técnico

Instrucciones de manipulación

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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