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Gedatolisib (PKI-587) PI3K inhibitor

Cat. No.: S2628

Gedatolisib (PKI-587) is a highly potent dual inhibitor of PI3Kα, PI3Kγ and mTOR with IC50 of 0.4 nM, 5.4 nM and 1.6 nM in cell-free assays, respectively. This compound is currently in Phase 2.
Gedatolisib (PKI-587) PI3K inhibitor Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 615.73

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Control de calidad (Quality Control)

Lote: Pureza: 99.09%
99.09

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
MDA-MB-361 cells Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human MDA-MB-361 cells, IC50=0.004 μM
PC3MM2 cells Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human PC3MM2 cells, IC50=0.0131 μM
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of Akt T308 phosphorylation in human MDA-MB-361 cells by Western blotting, IC50=0.008 μM
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of Akt S473 phosphorylation in human MDA-MB-361 cells by Western blotting, IC50=0.01 μM
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of eNOS phosphorylation in human MDA-MB-361 cells by Western blotting
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of PARS40 phosphorylation in human MDA-MB-361 cells by Western blotting
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of GSK3 kinase phosphorylation in human MDA-MB-361 cells by Western blotting
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of mTOR TORC1 kinase activity in human MDA-MB-361 cells assessed as suppression of p70S6K phosphorylation at < 30 nM
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of mTOR TORC1 kinase activity in human MDA-MB-361 cells assessed as suppression of 4EBP1 phosphorylation at < 30 nM
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of Akt T308 phosphorylation in human MDA-MB-361 cells xenografted mouse model upto 36 hrs
MDA-MB-361 cells Function assay Inhibition of Akt S473 phosphorylation in human MDA-MB-361 cells xenografted mouse model upto 36 hrs
MDA-MB-361 cells Function assay Induction of PARP cleavage in human MDA-MB-361 cells xenografted mouse model upto 18 hrs
MDA-MB-361 cells Function assay Antitumor activity against human MDA-MB-361 cells xenografted mouse model assessed as reduction in tumor volume at 20 mg/kg, iv on day 1, 5, 9
SF9 insect cells Function assay 2 h Inhibition of human PI3Kalpha expressed in SF9 insect cells after 2 hrs by fluorescence polarization assay, IC50=0.0004 μM
SF9 insect cells Function assay 2 h Inhibition of human PI3Kgamma expressed in SF9 insect cells after 2 hrs by fluorescence polarization assay, IC50=0.011μM
MDA-MB-361 cells Growth inhibition assay 72 h Growth inhibition of human MDA-MB-361 cells after 72 hrs, IC50=0.003 μM
human PC3 cells Growth inhibition assay 72 h Growth inhibition of human PC3 cells after 72 hrs, IC50=0.011 μM
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Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecular 615.73 Fórmula

C32H41N9O4

Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 1197160-78-3 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos PF-05212384 Smiles CN(C)C1CCN(CC1)C(=O)C2=CC=C(C=C2)NC(=O)NC3=CC=C(C=C3)C4=NC(=NC(=N4)N5CCOCC5)N6CCOCC6

Solubilidad (Solubility)

In vitro
Lote:

DMSO : 3 mg/mL (4.87 mM)
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Ethanol : 1 mg/mL

Water : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
PI3Kα
(Cell-free assay)
0.4 nM
mTOR
(Cell-free assay)
1.6 nM
PI3Kγ
(Cell-free assay)
5.4 nM
In vitro
Gedatolisib (PKI-587) shows potent inhibitory activity against PI3K-α, PI3K-γ and mTOR with IC50 of 0.4 nM, 5.4 nM and 1.6 nM, respectively. Furthermore, it also exhibits its potency against the most frequently occurring mutant forms of PI3Kα, notably the H1047R and E545K with IC50 of 0.6 nM and 0.6 nM, respectively. Correlated with suppression of phosphorylation of PI3K/mTOR signaling pathway proteins, this compound causes tumor cell growth inhibition in MDA-361 and PC3-MM2 cell lines with IC50 of 4 nM and 13.1 nM, respectively.
Ensayo de quinasa
Ensayo de cinasa PI3K y mTOR
Los ensayos enzimáticos se realizan en formato de polarización fluorescente (FP), adaptado del protocolo del kit de ensayo PI3K FP Echelon K-1100. Las PI3K humanas de clase I y los mutantes de PI3K-α (E545K y H1047R) se producen en Sf9 o se adquieren de Upstate Biotech. La GST-GRP1 (murina) se produce en Escherichia coli y se aísla mediante GST-Sepharose. Los tampones de ensayo son tampón de reacción [20 mM HEPES (pH 7,1), 2 mM MgCl2, 0,05 % CHAPS y 0,01 % β-mercaptoetanol] y tampón de parada/detección [100 mM HEPES (pH 7,5), 4 mM EDTA, 0,05 % CHAPS]. La reacción de FP se ejecuta durante 30 minutos a temperatura ambiente en 20 μL de tampón de reacción que contiene 20 μM de fosfatidilinositol 4,5-bisfosfato (PIP2), 25 μM de ATP y <4 % de DMSO. La reacción de FP se detiene con 20 μL de tampón de parada/detección (10 nM de sonda y 40 nM de GST-GRP), y después de 2 horas, los datos se recogen utilizando un lector de placas Envision. Los ensayos de rutina con FLAG-TOR purificado (FL y 3.5) se realizan en placas de 96 pocillos de la siguiente manera: Las enzimas se diluyen primero en tampón de ensayo de cinasa (10 mM Hepes (pH 7,4), 50 mM NaCl, 50 mM β-glicerofosfato, 10 mM MnCl2, 0,5 mM DTT, 0,25 μM microcistina LR y 100 μg/mL BSA). En cada pocillo, 12 μL de la enzima diluida se mezclan brevemente con 0,5 μL de inhibidor de prueba o vehículo de control dimetilsulfóxido (DMSO), siendo el inhibidor de prueba Gedatolisib (PKI-587). La reacción de la cinasa se inicia añadiendo 12,5 μL de tampón de ensayo de cinasa que contiene ATP y His6-S6K para dar un volumen de reacción final de 25 μL que contiene 800 ng/mL de FLAG-TOR, 100 μM de ATP y 1,25 μM de His6-S6K. La placa de reacción se incuba durante 2 horas (lineal a 1–6 horas) a temperatura ambiente con agitación suave y luego se termina añadiendo 25 μL de tampón de parada (20 mM Hepes (pH 7,4), 20 mM EDTA y 20 mM EGTA).
In vivo
Gedatolisib (PKI-587) treatment at 25 mg/kg iv in nude mice leads to low plasma clearance (7 (mL/min)/kg), high volume of distribution (7.2 L/kg), and long half-life (14.4 hours). In the MDA-361 xenograft model, it produces potent antitumor efficacy with the minimum efficacious dose (MED) of 3 mg/kg against MDA-361 tumors and maximum tolerated single dose (MTD) of 30 mg/kg. While in the H1975 (non-small-cell lung carcinoma, mutant EGFR [L858R, T790M]) xenograft model, this compound at 25 mg/kg for 7 weeks results in 90% survival of the group treated.
Referencias

Aplicaciones (Applications)

Métodos Biomarcadores Imágenes PMID
Growth inhibition assay Cell viability
S2628-viability1
29978469
Western blot p-AKT / p-mTOR / p-p70S6K / p-S6K / p-4E-BP1 / AKT / mTOR / p70S6K / S6K / 4EBP1 TSC1 / TSC2 / Raptor
S2628-WB1
29978469

Información del ensayo clínico (Clinical Trial Information)

(datos de https://clinicaltrials.gov, actualizado el 2024-05-22)

Número NCT Reclutamiento Condiciones Patrocinador/Colaboradores Fecha de inicio Fases
NCT02438761 Terminated
Therapy-related Acute Myeloid Leukemia and Myelodysplastic Syndrome|Acute Myeloid Leukemia in Relapse|de Novo Acute Myeloid Leukemia at Diagnostic
Institut Curie|Fondation ARC|National Cancer Institute France
August 31 2015 Phase 2
NCT02069158 Completed
Breast Cancer|NSCLC|Ovary Cancer|Endometrial Cancer|Small Cell Lung Cancer (SCLC)|Head and Neck (HNSCC)
Cristiana Sessa|Oncology Institute of Southern Switzerland
April 2014 Phase 1
NCT01420081 Terminated
Endometrial Neoplasms
Pfizer
January 19 2012 Phase 2