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Pracinostat (SB939) HDAC inhibidor

Cat. No.S1515

Pracinostat (SB939) es un potente inhibidor pan-HDAC con un IC50 de 40-140 nM, con excepción de HDAC6. No tiene actividad contra la isoenzima de clase III SIRT I. Este compuesto induce apoptosis en células tumorales. Fase 2.
Pracinostat (SB939) HDAC inhibidor Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 358.48

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Control de calidad

Lote: Pureza: 99.99%
99.99

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
MCF7 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.17 μM 24119555
NCI-H460 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human NCI-H460 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.22 μM 24119555
HCT116 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.24 μM 24119555
MDA-MB-435 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human MDA-MB-435 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.48 μM 24119555
OVCAR5 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human OVCAR5 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.61 μM 24119555
HepG2 Antimalarial assay Antimalarial activity against exo-erythrocytic form of Plasmodium berghei infected in human HepG2 cells, IC50 = 0.15 μM. 24904967
HepG2 Antiplasmodial assay 53 hrs Antiplasmodial activity against exoerythrocytic-stage of Plasmodium berghei ANKA infected in human HepG2 cells after 53 hrs by DAPI staining-based method, IC50 = 0.15 μM. 28241112
Sf9 Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-2 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
HEK293-F Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-8 expressed in HEK293-F cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
Sf9 Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-1 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
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Información química, almacenamiento y estabilidad

Peso molecular 358.48 Fórmula

C20H30N4O2

Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 929016-96-6 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos N/A Smiles CCCCC1=NC2=C(N1CCN(CC)CC)C=CC(=C2)C=CC(=O)NO

Solubilidad

In vitro
Lote:

DMSO : 72 mg/mL (200.84 mM)
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Ethanol : 27 mg/mL

Water : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción

Características
A new histone deacetylase inhibitor based on hydroxamic acid, with improved physicochemical, pharmaceutical, and pharmacokinetic properties.
Targets/IC50/Ki
HDAC10
(Cell-free assay)
40 nM
HDAC3
(Cell-free assay)
43 nM
HDAC5
(Cell-free assay)
47 nM
HDAC1
(Cell-free assay)
49 nM
HDAC4
(Cell-free assay)
56 nM
HDAC9
(Cell-free assay)
70 nM
HDAC11
(Cell-free assay)
93 nM
HDAC2
(Cell-free assay)
96 nM
HDAC7
(Cell-free assay)
137 nM
HDAC8
(Cell-free assay)
140 nM
HDAC6
(Cell-free assay)
1.008 μM
In vitro

Pracinostat (SB939) tiene una selectividad 100 veces mayor para las HDAC que para las enzimas, receptores y canales iónicos no HDAC de unión a Zn. Este compuesto es un potente inhibidor de las isoenzimas HDAC de clase I, HDAC1, HDAC2, HDAC3 y HDAC8 con valores de IC50 que van de 43 nM a 140 nM. Inhibe significativamente las isoenzimas HDAC de clase II, HDAC4, HDAC5, HDAC7, HDAC9 y HDAC10 con valores de IC50 que van de 40 nM a 137 nM, con la excepción de HDAC6, que muestra un IC50 de 1008 nM. Inhibe marcadamente HDAC11 de las enzimas HDAC de clase IV con un IC50 de 93 nM, pero no muestra actividad inhibidora contra SIRT 1 de las HDAC de clase III. Este producto químico muestra una actividad antiproliferativa significativa contra una amplia variedad de líneas celulares tumorales, especialmente células de leucemia y células de linfoma cutáneo de células T con valores de IC50 que van de 50 nM (células H9) a 170 nM (células HEL92.1.7).

Ensayo de quinasa
Ensayo enzimático de HDAC
Todas las enzimas HDAC recombinantes, con la excepción de SIRT1, se clonan y expresan en S*BIO. La mezcla de reacción que contiene 2,5 o 5 μL de la isoenzima HDAC, tampón de ensayo (25 mM Tris-HCl, pH 7,5; 137 mM NaCl; 2,7 mM KCl, 1 mM MgCl2 y 1 mg/mL BSA), diferentes concentraciones de este compuesto y el sustrato desacetilasa fluorogénico Flour de LysTM en un volumen de reacción total de 33 μL se incuba a temperatura ambiente durante 2 horas. Se añaden 16 μL de revelador Flour de LysTM y se incuban durante 10 minutos adicionales. La luz emitida se mide a 460 nm en un lector de microplacas. Los valores de IC50 se generan utilizando el software XLfit.
In vivo

La administración de este compuesto (25 mg/kg a 100 mg/kg) muestra una eficacia antitumoral dependiente de la dosis en un modelo murino de xenoinjerto de cáncer colorrectal humano (HCT-116). Esto es aproximadamente el doble de eficaz que SAHA: este químico causa una inhibición del crecimiento tumoral del 94 % frente al 48 % de SAHA, ambos a la dosis máxima tolerada. La administración oral de este agente a una dosis de 50 mg/kg o 75 mg/kg en el modelo genético de ratones APCmin de cáncer de colon en etapa temprana reduce notablemente el número de tumores, disminuye las puntuaciones acumuladas de hemocultivos y aumenta los valores de hematocrito de forma más eficaz.

Referencias

Aplicaciones

Métodos Biomarcadores Imágenes PMID
Western blot p-JAK2 / JAK2 / p-STAT5 / STAT5 / p-FLT3 / FLT3
S1515-WB1
22829971

Información del ensayo clínico

(datos de https://clinicaltrials.gov, actualizado el 2024-05-22)

Número NCT Reclutamiento Condiciones Patrocinador/Colaboradores Fecha de inicio Fases
NCT02118909 Completed
Healthy Volunteers|Non-smokers
Helsinn Healthcare SA
May 2014 Phase 1
NCT02058784 Completed
Healthy Volunteers|Moderate to Heavy Smokers|Non-smokers
Helsinn Healthcare SA|Celerion
February 2014 Early Phase 1
NCT01112384 Completed
Metastatic Sarcoma
NCIC Clinical Trials Group|S*BIO|Canadian Cancer Trials Group
October 21 2010 Phase 2
NCT00741234 Completed
Solid Tumors|Hematologic Malignancies|Myelodysplastic Syndrome
S*BIO
April 2007 Phase 1

Soporte técnico

Instrucciones de manipulación

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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