solo para uso en investigación

PFI-3 SMARCA4 químico

Cat. No.S7315

PFI-3 es una sonda química selectiva para los bromodominios SMARCA, incluidos los bromodominios SMARCA2, SMARCA4 y PB1(5).
PFI-3 SMARCA4 químico Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 321.37

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Control de calidad

Lote: Pureza: 99.87%
99.87

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
BL21(DE3)-R3-pRARE2 Function assay Binding affinity to His6-tagged human recombinant PB1 bromodomain isoform 5 expressed in Escherichia coli BL21(DE3)-R3-pRARE2 cells by VP-ITC microcalorimetry, Kd=0.048μM 27119626
BL21(DE3)-R3-pRARE2 Function assay Binding affinity to His6-tagged human recombinant SMARCA4 bromodomain expressed in Escherichia coli BL21(DE3)-R3-pRARE2 cells by VP-ITC microcalorimetry, Kd=0.089μM 27119626
BL21 (DE3)-R3-BirA Function assay Binding affinity to human PB1 isoform 5 expressed in BL21 (DE3)-R3-BirA cells by isothermal titration calorimetry, Kd<0.1μM 27115555
BL21 (DE3)-R3-BirA Function assay Binding affinity to human SMARCA4 expressed in BL21 (DE3)-R3-BirA cells by isothermal titration calorimetry, Kd<0.1μM 27115555
C2C12 Function assay 500 nM to 50 uM Inhibition of differentiation in mouse C2C12 cells assessed as shortening of myotubes with lower nuclei at 500 nM to 50 uM by HRP-peroxidase-based immunocytochemistry relative to control 27115555
C2C12 Function assay 1 uM Inhibition of differentiation in mouse C2C12 cells assessed as suppression of MyHC expression at 1 uM by HRP-peroxidase-based immunocytochemistry 27115555
C3H10T1/2 Function assay 1 uM Inhibition of differentiation of mouse C3H10T1/2 cells to adipocytes assessed as lipid accumulation at 1 uM by oil red O staining-based assay 27115555
C3H10T1/2 Function assay 20 uM Inhibition of differentiation of mouse C3H10T1/2 cells to adipocytes assessed as lipid accumulation at 20 uM by oil red O staining-based assay 27115555
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Información química, almacenamiento y estabilidad

Peso molecular 321.37 Fórmula

C19H19N3O2

Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 1819363-80-8 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos N/A Smiles C1C2CN(C1CN2C3=CC=CC=N3)C=CC(=O)C4=CC=CC=C4O

Solubilidad

In vitro
Lote:

DMSO : 64 mg/mL (199.14 mM)
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción

Targets/IC50/Ki
PB1(5) bromodomains
SMARCA4
(Cell-free assay)
55 nM(Kd)
SMARCA2B
(Cell-free assay)
72 nM(Kd)
SMARCA2A
(Cell-free assay)
110 nM(Kd)
In vitro
PFI-3 muestra una selectividad significativa para PB1(5) y SMARCA2/4 sobre otras 36 quinasas probadas. Este compuesto es un potente inhibidor de la interacción proteica activo en células que se une selectivamente a los bromodominios BAF esenciales. Se ha probado en un panel de cribado comercial que comprende 102 receptores celulares y 30 ensayos enzimáticos, revelando solo interacciones contra cuatro GPCR con afinidad micromolar y ninguna interacción adicional significativa fuera de la familia BRD, lo que confirma su excelente selectividad farmacológica más amplia. Las mediciones de estabilidad confirmaron que este químico tiene una vida media en soluciones acuosas superior a 7 días a 37 °C. En experimentos a largo plazo, alteró significativamente los programas de expresión génica que son importantes para la diferenciación de células madre. Este compuesto imita el efecto de la deleción de Brg1, lo que resulta en un aumento de la marca represiva H3K27me3 en los TSS y los sitios de unión de Stat3 de estos genes. Tiene una vida media de >250 h en PBS, pH 7,4, a 20 °C.
Referencias
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26139243/

Aplicaciones

Métodos Biomarcadores Imágenes PMID
Immunofluorescence SMARCA2 BRD
S7315-IF1
26139243

Soporte técnico

Instrucciones de manipulación

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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