uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden
Cat.Nr.S8071
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK Histone Acetyltransferase |
|---|---|
| Overige Histone Methyltransferase Inhibitoren | Pinometostat (EPZ5676) 3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride BIX-01294 trihydrochloride UNC1999 EPZ015666 (GSK3235025) EPZ004777 MM-102 (HMTase Inhibitor IX) Chaetocin SGC 0946 EPZ005687 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 22Rv1 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human 22Rv1 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.048 μM | ||||
| PC3 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human PC3 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.059 μM | ||||
| MCF7 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human MCF7 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.07 μM | ||||
| MDA-MB-231 cells | Function assay | 48 h | Inhibition of G9a in human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by clonogenic assay, IC50=0.081 μM | |||
| IMR90 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human IMR90 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.12 μM | ||||
| HCT116 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human HCT116 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.21 μM | ||||
| H1299 cells | Function assay | 0.25 uM | 24 h | Inhibition of G9a expressed in H1299 cells assessed as inhibition of dimethylation of p53 at lys 373 at 0.25 uM after 24 hrs by Western blot analysis | ||
| Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken | ||||||
| Moleculair gewicht | 509.73 | Formule | C30H47N5O2 |
Opslag (Vanaf de ontvangstdatum) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 1255580-76-7 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
|
In vitro |
DMSO
: 100 mg/mL
(196.18 mM)
Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
G9a
(Cell-free assay) <15 nM
GLP
(Cell-free assay) 19 nM
|
|---|---|
| In vitro |
UNC0638 is een potente, selectieve en celpenetrerende chemische probe voor G9a en GLP, met een toxiciteit/functie-verhouding van >100, vergeleken met <6 voor BIX01294. Deze verbinding is een selectieve remmer van G9a en GLP over een breed scala aan epigenetische en niet-epigenetische doelwitten. Het is meer dan 10.000-voudig selectief tegen SET7/9 (een H3K4 HMTase), SET8 (een H4K20 HMTase), PRMT3 en SUV39H2. In MDA-MB-231-cellen vermindert deze chemische stof (48 uur blootstelling) de H3K9me2-niveaus op een concentratieafhankelijke manier met een IC50 van 81 nM. De behandeling van een verscheidenheid aan cellijnen resulteert in lagere globale H3K9me2-niveaus, equivalent aan niveaus waargenomen voor kleine haarspeld-RNA-knockdown van G9a en GLP, waarbij de functionele potentie van deze verbinding goed gescheiden is van zijn toxiciteit. Het vermindert de clonogeniciteit van MCF7-cellen aanzienlijk, vermindert de abundantie van H3K9me2-markeringen bij promotors van bekende G9a-gereguleerde endogene genen en beïnvloedt onevenredig verschillende genomische loci die microRNA's coderen. In embryonale stamcellen van muizen reactiveert deze probe G9a-silenced genen en een retroviraal reportergen op een concentratieafhankelijke manier zonder differentiatie te bevorderen.
|
| Kinase Assay |
SAHH-gekoppelde testen
|
|
Deze test maakt gebruik van SAHH om het methyltransferproduct S-adenosylhomocysteïne te hydrolyseren tot homocysteïne en adenosine in aanwezigheid van adenosine deaminase dat adenosine omzet in inosine. De homocysteïneconcentratie wordt vervolgens bepaald door conjugatie van zijn vrije sulfhydrylgroep met een thiol-gevoelige fluorofoor, ThioGlo. Voor IC50-bepalingen worden testmengsels bereid in 25 mM kaliumfosfaatbuffer pH 7.5, 1 mM EDTA, 2 mM MgCl2, 0.01% Triton X 100 met 5 μM SAHH, 0.3 U/mL adenosine deaminase, 25 μM SAM en 15 μM ThioGlo. G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3 en SUV39H2 worden getest bij respectievelijk 25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM en 100 nM. UNC0638 wordt toegevoegd in concentraties variërend van 4 nM tot 16 μM. Na 2 minuten incubatie worden reacties geïnitieerd door toevoeging van de histonpeptiden: 10 μM H3(1-25) voor G9a, 20 μM H3(1-25) voor EHMT1, 100 μM H3(1-25) voor SETD7, 500 μM H4(1-24) voor SETD8, 10 μM H4(1-24) voor PRMT3 en 200 μM H3K9Me1 (1-15) voor SUV39H2. De methyleringsreactie wordt gevolgd door het monitoren van de toename in fluorescentie met behulp van een Biotek Synergy2 plaatlezer met 360/40 nm excitatie filter en 528/20 nm emissie filter gedurende 20 minuten in een 384-well plaatformaat. Activiteitswaarden worden gecorrigeerd door achtergrond veroorzaakt door het peptide of het eiwit af te trekken. IC50-waarden worden berekend met Sigmaplot. Standaarddeviaties worden berekend uit twee onafhankelijke experimenten.
|
|
| In vivo |
In studies naar het metabolisme en de farmacokinetiek van geneesmiddelen bij muizen had UNC0638 een hoge klaring, korte halfwaardetijd, hoog distributievolume en lage blootstelling na intraveneuze, orale of intraperitoneale toediening. Hoewel deze verbinding waarschijnlijk niet geschikt is voor in vivo dierstudies vanwege de lage blootstellingsniveaus, maakt de hoge stabiliteit onder cellulaire testomstandigheden, in combinatie met hoge potentie en selectiviteit, het een ideaal chemisch hulpmiddel voor celgebaseerde studies.
|
Referenties |
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, kunt u een bericht achterlaten.