Name: CX-5461 (Pidnarulex)
Brand: Selleck Chemicals
SKU: S2684
Rating: 5 (84 reviews)

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Control de calidad (Quality Control)

Lote: Pureza: 99.07%

99.07

Dianas relacionadas	HDAC PARP ATM/ATR DNA-PK WRN Topoisomerase PPAR Sirtuin Casein Kinase eIF
Otros DNA/RNA Synthesis Inhibidores	SCR7 Favipiravir (T-705) EED226 RK-33 BMH-21 Carmofur Triapine (3-AP) YK-4-279 Halofuginone Tegafur (FT-207)

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Líneas celulares	Tipo de ensayo	Concentración	Tiempo de incubación	Descripción de la actividad	PMID
MNNG	Cell viability assay		72 h	IC50=0.5-1.5 µM	27729807
U2-OS	Cell viability assay		72 h	IC50=0.5-1.5 µM	27729807
RS4;11	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
SEM	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
KOPN-8	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
NALM-6	Proliferation assay	250 nM	24 h	time dependent decrease in proliferation relative to their DMSO treated controls	26472108
NB-EBc1	qHTS assay			qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells	29435139
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Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecular	513.61	Fórmula	C₂₇H₂₇N₇O₂S	Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)	3 years-20°C(in the dark) powder
Nº CAS	1138549-36-6	Descargar SDF		Almacenamiento de soluciones madre	1 año-80°Cen disolvente 1 mes-20°Cen disolvente
Sinónimos	N/A			Smiles	CC1=CN=C(C=N1)CNC(=O)C2=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C5=C(C2=O)C=CC(=N5)N6CCCN(CC6)C

Solubilidad (Solubility)

In vitro
Lote:

DMSO : Insoluble
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa	Concentración	Volumen	Peso molecular
=	×	×

Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo Lote:
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Clear solution	5%DMSO 1 40%PEG300 2 5%Tween80 3 50%ddH2O Validado por los laboratorios Selleck. Si necesita ajustes en esta formulación, contacte con nuestro equipo de ventas para pruebas personalizadas.	0.150mg/ml (0.29mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 3 mg/ml clarified DMSO stock solution to 400 μL PEG300, mix evenly to clarify it; add 50 μL Tween80 to the above system, mix evenly to clarify it; then continue to add 500 μL ddH2O to adjust the volume to 1 mL. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Clear solution	5% DMSO 1 95% corn oil Validado por los laboratorios Selleck. Si necesita ajustes en esta formulación, contacte con nuestro equipo de ventas para pruebas personalizadas.	0.150mg/ml (0.29mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 3 mg/ml clear DMSO stock solution to 950 μL of corn oil and mix evenly. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Clear solution	5%DMF 1 40%PEG300 2 5%Tween80 3 50%ddH2O Validado por los laboratorios Selleck. Si necesita ajustes en esta formulación, contacte con nuestro equipo de ventas para pruebas personalizadas.	2.000mg/ml (3.89mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL 40 mg/ml clarified DMF stock solution to 400 μL PEG300, mix evenly to clarify it; add 50 μL Tween80 to the above system, mix evenly to clarify it; then continue to add 500 μL ddH2O to adjust the volume to 1 mL. . The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Homogeneous suspension	CMC-NA	≥5mg/ml	Taking the 1 mL working solution as an example, add 5 mg of this product to 1 ml of CMC-Na solution, mix evenly to obtain a homogeneous suspension with a final concentration of 5 mg/ml.
Clear solution	5%DMF 1 95%Corn oil Validado por los laboratorios Selleck. Si necesita ajustes en esta formulación, contacte con nuestro equipo de ventas para pruebas personalizadas.	2.000mg/ml (3.89mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 40 mg/ml clarified DMF stock solution to 950 μL of corn oil and mix evenly. The mixed solution should be used immediately for optimal results.
Clear solution	5%DMF 1 95%Corn oil Validado por los laboratorios Selleck. Si necesita ajustes en esta formulación, contacte con nuestro equipo de ventas para pruebas personalizadas.	2.000mg/ml (3.89mM)	Taking the 1 mL working solution as an example, add 50 μL of 40 mg/ml clarified DMF stock solution to 950 μL of corn oil and mix evenly. The mixed solution should be used immediately for optimal results.

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

Dosis: mg/kg Peso promedio de los animales: g Volumen de dosificación por animal:μL Número de animales:

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO + % + % Tween 80 + % ddH₂O

%DMSO+ %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH₂O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Targets/IC₅₀/Ki	Pol I-driven transcription of rRNA (HCT-116, A375, MIA PaCa-2 cells) 142 nM
In vitro	Se ha encontrado que CX-5461 (Pidnarulex) inhibe selectivamente la rRNA synthesis (Pol I IC50=142 nM; Pol II IC50 > 25 µM; selectividad ~200 veces) en las células HCT-116. Esta inhibición selectiva se confirma en otras dos líneas celulares de tumores sólidos humanos: melanoma A375 (Pol I IC50 = 113 nM; Pol II IC50 > 25 µM) y carcinoma pancreático MIA PaCa-2 (Pol I IC50=54 nM; Pol II IC50 ~25 mM). Posee una selectividad de 250 a 300 veces para la inhibición de la transcripción de ARNr frente a la replicación del ADN y la traducción de proteínas. El compuesto exhibe una amplia potencia antiproliferativa en un panel de líneas celulares cancerosas humanas, pero tiene un efecto mínimo sobre la viabilidad de las células humanas no transformadas. La EC50 media en todas las líneas celulares probadas es de 147 nM, mientras que todas las líneas celulares normales tienen valores de EC50 de aproximadamente 5 000 nM. La evaluación de la respuesta a la dosis antiproliferativa para las líneas celulares HCT-116, A375 y MIA PaCa-2 arroja valores de EC50 de 167, 58 y 74 nM. Induce autofagia y senescencia en células cancerosas de tumores sólidos, en lugar de apoptosis, a través de un proceso independiente de p53.
Ensayo de quinasa	Ensayo de transcripción de Pol I y Pol II
Ensayo de quinasa	Se cuantifican dos transcritos de ARN de vida corta (semividas ~20-30 minutos), uno producido por Pol I y otro por Pol II, mediante qRT-PCR como medida de los efectos relacionados con CX-5461 (Pidnarulex) sobre la transcripción. El pre-ARNr 45S sirvió como transcrito de Pol I y el ARNm del protooncogén c-myc sirvió como transcrito de Pol II de comparación. Se sabe que tanto la transcripción de Pol I como la de Pol II se ven afectadas por el estrés celular general. Para minimizar los posibles efectos de dicho estrés, las células se exponen a los agentes de prueba durante un corto período de tiempo (2 horas) solamente. Este tiempo es suficiente para que estos transcritos se reduzcan en más del 90% si este compuesto afecta su síntesis.
In vivo	CX-5461 (Pidnarulex) es biodisponible por vía oral y demuestra actividad antitumoral in vivo contra tumores sólidos humanos en modelos de xenoinjertos murinos. Este compuesto demuestra una TGI significativa de MIA PaCa-2 con una TGI igual al 69% el día 31. Del mismo modo, demuestra una TGI significativa de A375 con una TGI igual al 79% el día 32.
Referencias	[1] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21159662/

Aplicaciones (Applications)

Métodos	Biomarcadores	PMID
Western blot	Cyclin D1 / p53 / p16 53BP1 / γ-H2AX / p-ATM Bcl-2 / Bax / Caspase3 cleaved PARP / cleaved Caspase-9 / cleaved caspase-3 p-AMPK / AMPK / p-mTOR / mTOR EG5 / Histone H3 / p-Histone H3 (S10)	29631594
Immunofluorescence	Vimentin / Phalloidin / Snail1 Rictor / Calnexin Fibrillarin LC3 γH2AX / 53BP1 / RPA / RAD51 chromosome / telomere F-actin / Aurora B	31068593
Growth inhibition assay	Cell viability	26061708

Información del ensayo clínico (Clinical Trial Information)

(datos de https://clinicaltrials.gov, actualizado el 2024-05-22)

Número NCT	Reclutamiento	Condiciones	Patrocinador/Colaboradores	Fecha de inicio	Fases
NCT02719977	Completed	Cancer	Canadian Cancer Trials Group\|Senhwa Biosciences Inc.\|Stand Up To Cancer	June 13 2016	Phase 1

Preguntas frecuentes (Frequently Asked Questions)

Pregunta 1:
I want to make it for further in vivo treatment.

Respuesta:
This compound has poor solubility in common vehicles. It can be dissolved in DMF at 3 mg/ml with warming.

C1=C0/X	C1:	LOG(C1):
C2=C1/X	C2:	LOG(C2):
C3=C2/X	C3:	LOG(C3):
C4=C3/X	C4:	LOG(C4):
C5=C4/X	C5:	LOG(C5):
C6=C5/X	C6:	LOG(C6):
C7=C6/X	C7:	LOG(C7):
C8=C7/X	C8:	LOG(C8):

CX-5461 (Pidnarulex) RNA Polymerase I inhibitor

Estructura química

Peso molecular: 513.61

Control de calidad (Quality Control)

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Solubilidad (Solubility)

Calculadora de Molaridad

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Aplicaciones (Applications)

Información del ensayo clínico (Clinical Trial Information)

Preguntas frecuentes (Frequently Asked Questions)

CX-5461 (Pidnarulex) RNA Polymerase I inhibitor

Estructura química

Peso molecular: 513.61

Control de calidad (Quality Control)

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo (Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Solubilidad (Solubility)

Calculadora de Molaridad

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Aplicaciones (Applications)

Información del ensayo clínico (Clinical Trial Information)

Preguntas frecuentes (Frequently Asked Questions)

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)