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Sodium butyrate HDAC Inhibidor

Cat. No.: S1999

Sodium butyrate (NaB, Butanoic acid sodium salt), sal sódica del ácido butírico, es un inhibidor de la histone deacetylase y se une competitivamente a los sitios de zinc de las histone deacetylases (HDACs) de clase I y II. Este compuesto inhibe la progresión del ciclo celular, promueve la diferenciación e induce la apoptosis y la autophagy en varios tipos de células cancerosas.
Sodium butyrate HDAC Inhibidor Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 110.09

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Control de calidad (Quality Control)

Lote: Pureza: 100.00%
100.00

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
human K562 cells Proliferation assay 1 mM Antiproliferative activity against human K562 cells at 1 mM in presence of guanosine
human H1299 cells Function assay 7 days Inhibition of human USP1/UAF1 in human H1299 cells assessed as reduction in colony formation after 7 days, EC50=3 μM
human JEG3 cells Function assay Inhibition of aromatase in human JEG3 cells by scintillation spectrometry, IC50=0.0015 μM
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Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecular 110.09 Fórmula

C4H7NaO2

Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 156-54-7 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos NaB, Butanoic acid sodium salt Smiles CCCC(=O)[O-].[Na+]

Solubilidad (Solubility)

In vitro
Lote:

Water : 22 mg/mL

Ethanol : 8 mg/mL

DMSO : Insoluble
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
Histone deacetylase
In vitro
Butyrate mediates growth inhibition of colonic cancer cells and thereby to elucidate the molecular link between a high-fiber diet and the arrest of colon carcinogenesis. This compound induces p21 mRNA expression in an immediate-early fashion, through transactivation of a promoter cis-element(s) located within 1.4 kb of the transcriptional start site, independent of p53 binding. Sodium butyrate, at physiological concentrations, induces apoptosis in 2 adenoma cell lines, RG/C2 and AA/Cl, and in the carcinoma cell line PC/JW/FI. It exerts potent effects on a variety of colonic mucosal functions such as inhibition of inflammation and carcinogenesis, reinforcing various components of the colonic defence barrier and decreasing oxidative stress. This chemical inhibits most HDAC except class III HDAC and class II HDAC6 and -10. It also is the most effective fatty acid in stimulating or repressing the expression of specific genes.
In vivo
Sodium butyrate significantly extends survival in a dose-dependent manner, improves body weight and motor performance, and delays the neuropathological sequelae in the R6/2 transgenic mouse model of Huntington's disease (HD). This compound also increases histone and specificity protein-1 acetylation and protects against 3-nitropropionic acid neurotoxicity.
Referencias
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12840228/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561870/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/649576/

Aplicaciones (Applications)

Métodos Biomarcadores Imágenes PMID
Western blot Cyclin D3 / CDK4 / CDK6 / CDK2 p15INK4b / p21Cip1 Phospho-H3 Ser10 / Acetyl-H3Lys9 / Acetyl-H3Lys14 / Dimethyl-H3
S1999-WB1
24280698
Immunofluorescence Acetyl-H3Lys9
S1999-IF1
24280698

Información del ensayo clínico (Clinical Trial Information)

(datos de https://clinicaltrials.gov, actualizado el 2024-05-22)

Número NCT Reclutamiento Condiciones Patrocinador/Colaboradores Fecha de inicio Fases
NCT00800930 Completed
Shigellosis
International Centre for Diarrhoeal Disease Research Bangladesh|Swedish International Development Cooperation Agency (SIDA)|Karolinska Institutet
January 2005 Phase 2