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PHA-793887 CDK inhibitor

Cat. No.: S1487

PHA-793887 is a novel and potent inhibitor of CDK2, CDK5 and CDK7 with IC50 of 8 nM, 5 nM and 10 nM. It is greater than 6-fold more selective for CDK2, 5, and 7 than CDK1, 4, and 9. This compound induces cell-cycle arrest and apoptosis. Phase 1.
PHA-793887 CDK inhibitor Chemical Structure

Estructura química

Peso molecular: 361.48

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Control de calidad (Quality Control)

Lote: S148701 DMSO]72 mg/mL]false]Ethanol]72 mg/mL]false]Water]Insoluble]false Pureza: 99.64%
99.64

Cultivo celular, tratamiento y concentración de trabajo
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Líneas celulares Tipo de ensayo Concentración Tiempo de incubación Formulación Descripción de la actividad PMID
human A2780 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human A2780 cells after 72 hrs by fluorescence assay, IC50=0.09 μM
human HCT116 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.163 μM
human COLO205 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human COLO205 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.188 μM
human C-433 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human C-433 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.285 μM
human DU145 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human DU145 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.303 μM
human A375 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human A375 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.396 μM
human PC3 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human PC3 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=0.601 μM
human MCF7 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=1.284 μM
human BxPC3 cells Proliferation assay 72 h Antiproliferative activity against human BxPC3 cells after 72 hrs by SRB assay, IC50=3.444 μM
human A2780 cells Function assay 3 μM Inhibition of CDK in human A2780 cells assessed as accumulation of hypophosphorylated form of retinoblastoma protein at 3 uM by immunohistochemistry
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Información química, almacenamiento y estabilidad (Chemical Information, Storage & Stability)

Peso molecular 361.48 Fórmula

C19H31N5O2

Almacenamiento (Desde la fecha de recepción)
Nº CAS 718630-59-2 Descargar SDF Almacenamiento de soluciones madre

Sinónimos N/A Smiles CC(C)CC(=O)NC1=NNC2=C1CN(C2(C)C)C(=O)C3CCN(CC3)C

Solubilidad (Solubility)

In vitro
Lote:

DMSO : 72 mg/mL (199.18 mM)
(El DMSO contaminado con humedad puede reducir la solubilidad. Usar DMSO fresco y anhidro.)

Ethanol : 72 mg/mL

Water : Insoluble

Calculadora de Molaridad

Masa Concentración Volumen Peso molecular
Calculadora de Dilución Calculadora de Peso Molecular

In vivo
Lote:

Calculadora de formulación in vivo (Solución clara)

Paso 1: Introduzca la información a continuación (Recomendado: Un animal adicional para tener en cuenta la pérdida durante el experimento)

mg/kg g μL

Paso 2: Introduzca la formulación in vivo (Esto es solo la calculadora, no la formulación. Por favor, contáctenos primero si no hay una formulación in vivo en la sección de Solubilidad.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Resultados del cálculo:

Concentración de trabajo: mg/ml;

Método para preparar el líquido maestro de DMSO: mg fármaco predissuelto en μL DMSO ( Concentración del líquido maestro mg/mL, Por favor, contáctenos primero si la concentración excede la solubilidad del DMSO del lote del fármaco. )

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadirμL PEG300, mezclar y clarificar, luego añadirμL Tween 80, mezclar y clarificar, luego añadir μL ddH2O, mezclar y clarificar.

Método para preparar la formulación in vivo: Tomar μL DMSO líquido maestro, luego añadir μL Aceite de maíz, mezclar y clarificar.

Nota: 1. Por favor, asegúrese de que el líquido esté claro antes de añadir el siguiente disolvente.
2. Asegúrese de añadir el (los) disolvente(s) en orden. Debe asegurarse de que la solución obtenida, en la adición anterior, sea una solución clara antes de proceder a añadir el siguiente disolvente. Se pueden utilizar métodos físicos como el vórtice, el ultrasonido o el baño de agua caliente para ayudar a la disolución.

Mecanismo de acción (Mechanism of Action)

Características
Multi-CDK inhibitor.
Targets/IC50/Ki
CDK5/p25
(Cell-free assay)
5 nM
CDK2/CyclinA
(Cell-free assay)
8 nM
CDK2/CyclinE
(Cell-free assay)
8 nM
CDK7/CyclinH
(Cell-free assay)
10 nM
CDK1/CyclinB
(Cell-free assay)
60 nM
CDK4/CyclinD1
(Cell-free assay)
62 nM
GSK-3β
(Cell-free assay)
79 nM
CDK9/CyclinT1
(Cell-free assay)
138 nM
In vitro
PHA-793887 has low activity against CDK1, CDK4, CDK9 and GSK3β with IC50 of 60 nM, 62 nM, 138 nM and 79 nM, respectively. This compound inhibits cell proliferation of many tumor cell lines, including A2780, HCT-116, COLO-205, C-433, DU-145, A375, PC3, MCF-7, and BX-PC3, with IC50 of 88 nM–3.4 μM. It (1 μM) shows a decrease in the S phase, a subsequent increase of the G1 phase and a slight accumulation of G2/M phase in A2780 cells. This chemical (3 μM) significantly increases G2/M phase and reduces DNA synthsis. It is cytotoxic for leukemic cell lines, including K562, KU812, KCL22, and TOM1, with IC50 of 0.3–7 μM, but it is not cytotoxic for normal unstimulated peripheral blood mononuclear cells or CD34+ hematopoietic stem cells. In colony assays, this compound shows very high activity against leukemia cell lines with IC50 less than 0.1 μM. It induces cell-cycle arrest, inhibits Rb and nucleophosmin phosphorylation, and modulates cyclin E and cdc6 expression at 0.2−1 μM and induces apoptosis at 5 μM.
Ensayo de quinasa
Ensayo de quinasa CDK
La actividad bioquímica de los compuestos se determina mediante incubación con enzimas y sustratos específicos, seguida de la cuantificación del producto fosforilado. PHA-793887 (1,5 nM–10 μM) se incuba durante 30-90 min a temperatura ambiente en presencia de una mezcla de ATP/33P-γ-ATP, sustrato y la enzima específica (0,7-100 nM) en un volumen final de 30 μL de tampón de quinasa, utilizando placas de 96 pocillos con fondo en U. Tras la incubación, se detiene la reacción y se separa el sustrato fosforilado del ATP radiactivo no incorporado utilizando perlas SPA, resina Dowex o un filtro de fosfocelulosa Multiscreen de la siguiente manera: (1) Para ensayos SPA. La reacción se detiene añadiendo 100 μL de PBS + 32 mM EDTA + 0,1% Triton X-100 + 500 μM ATP, que contiene 1 mg de perlas SPA recubiertas de estreptavidina. Tras 20 min de incubación para la captura del sustrato, se transfieren 100 μL de la mezcla de reacción a placas Optiplate de 96 pocillos que contienen 100 μL de CsCl 5 M, se dejan reposar durante 4 horas para permitir la estratificación de las perlas en la parte superior de la placa y se cuentan mediante TopCount para medir el fosfato incorporado al sustrato. (2) Para ensayo con resina Dowex. Se añade una cantidad de 150 μL de resina/formiato, pH 3,00, para detener la reacción y capturar el 33P-γ-ATP que no ha reaccionado, separándolo del sustrato fosforilado en solución. Tras 60 min de reposo, se transfieren 50 μL de sobrenadante a placas Optiplate de 96 pocillos. Tras la adición de 150 μL de Microscint 40, la radiactividad se cuenta en el TopCount. (3) Para ensayo Multiscreen. La reacción se detiene añadiendo 10 μL de EDTA (150 mM). Se transfiere una cantidad de 100 μL a una placa MultiScreen para permitir la unión del sustrato al filtro de fosfocelulosa. A continuación, las placas se lavan tres veces con 100 μL de H2PO4 (75 mM) filtrado mediante un sistema de filtración MultiScreen y se secan. Tras la adición de 100 μL de Microscint 0, se cuenta la radiactividad en el TopCount. Los valores de IC50 se obtienen mediante análisis de regresión no lineal.
In vivo
PHA-793887 (10–30 mg/kg) shows good efficacy in the human ovarian A2780, colon HCT-116, and pancreatic BX-PC3 carcinoma xenograft models. This compound (20 mg/kg) is effective in xenograft models of K562 and HL60 cells, primary leukemic disseminated model, and a high-burden disseminated ALL-2 model derived from a relapsed Philadelphia-positive acute lymphoid leukemia patient.
Referencias